窖泥功能菌主要功能微生物：己酸菌、甲烷菌、酵母菌、放线菌、红曲霉菌等。

1、己酸菌

己酸菌是窖泥功能菌的关健微生物之一，要求菌种活性强，纯度高，耐酸性能好，具有较强的抗逆性。我们以多种己酸为出发菌株进行性能优化。最后选育出的菌种，在三角瓶中发酵3天，其己酸可达0.4﹪，培养7天，己酸含量能达0.8﹪以上。

2、酵母菌

从优质大曲中分离纯化得到，主要功能是转化己酸乙酯的能力强，而且生长快，耐有机酸（丁酸、乙酸对多种真核微生物有毒性），不对己酸菌等有益微生物产生拮抗作用。

3、红曲霉

红曲霉属半知菌科，因它具有一定的产酒精能力，具有又香又甜的着香性，产生较大量的酯化酶，是白酒生产重要的功能微生物，但该微生物生长能力较其它霉菌弱，在常规格化制曲工艺或窖泥培养中是相对缺乏的有效功能菌。本产品选用的红曲霉对己酸菌等有益微生物不产生拮抗作用，生产的白酒香气纯正，产生己酸乙酯的能力强。

脱水活性窖泥功能菌产品，是由齐鲁工业大学（原山东轻工业学院）与济南瑞丰生物工程有限公司共同承担的科技开发新产品，该项目于1998年通过山东省科委组织的技术鉴定。脱水活性窖泥功能菌制品，是在对浓香型白酒窖泥微生态理论的研究基础上，确定了主要影响浓香型白酒质量的多种窖泥功能微生物细胞进行保活脱水，使细胞存活率达 85%以上，保质期一年以上。产品能够显著提高浓香型白酒中己酸乙酯等香味成份的含量，降低乳酸乙酯含量，使白酒产品的质量有了显著的提高，并降低了生产成本，养窖效果明显，有效的保持窖泥的活性，增加白酒的质量，为白酒行业创造了显著的经济效益。

该产品于2004年获山东省科技进步三等奖。